■種・亜種分類

　比較的分類学的研究が進んでいる爬虫類ですが、隠ぺい種や亜種の問題がたくさん残されています。

■DNA情報を用いた島集団レベルの系統関係の記載

　同じ種でも、島ごとに明確に異なる遺伝的特徴を持っています。この違いを定量化することで、それぞれの島集団の成り立ちや、種分化の歴史的背景を明らかにすることができます。また、地史についてもある程度わかることがあります。

■大陸種との系統関係の解明

　琉球列島の動物がいつどこからどのようにしてやってきたのかを明らかにするためには、アジア大陸に分布する種との比較が必要不可欠です。中国の共同研究者の助けを借りて、この問題に取り組んでいます。

■島群集の形成プロセスに関する歴史的背景の解明

　琉球列島における種の分布の偏りを生み出した歴史的要因について研究しています。例えば、島ごとに分布する種が違うのは、かつて島と島が分断されたことで種分化したのか、といった疑問を明らかにします。